Affiliation
Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC)
Research Focus
Muscle stem cells face a crucial decision between differentiating to form new muscle or selfrenew to generate anew stem cell. The self-renewal process ensures the maintenance of a cell reservoir for future muscle growth and repair. In our research, we have identified proteins that are produced and degraded in a rhythmic manner within proliferating muscle stem cells, causing oscillations of the proteins. The dynamic presence of these proteins stabilizes a state in which myogenic cells remain undecided whether they will differentiate or self-renew. To delve deeper into this oscillatory network and its regulation, we aim to expand upon our previous analyses in which we used mice as model organisms. Our focus is on studying oscillatory proteins in human myogenic cells derived from induced pluripotent stem cells. Notably, we have observed oscillations in a key regulatory protein, MYOD, in human cells. Utilizing these human cells, our objective is to investigate how these oscillations synchronize between cells and define oscillations in muscle stem cells carrying mutations that cause myopathies in patients.
Affiliation
Humboldt-Universität zu Berlin (HU)
Research Focus
X-ray volume imaging is a powerful yet underdeveloped technique in neuroscience. The goal of our proposal is to move both micro-CT and synchrotron imaging to the center of neuroanatomy. X-ray techniques avoid the effortful section alignment that goes along with serial sectioning. We will perform micro-CT imaging on our micro-CT scanner and will apply for imaging time at the Synchrotron DESY (Hamburg) and ESRF (Grenoble). Because X-ray imaging allows a fast throughput of samples we think it could be instrumental in comparative studies of the human and animal brains. We will seek close collaboration with other NeuroCure PIs interested in X-ray imaging and human neuroanatomy. In addiditon to these X-ray studies, the Brecht lab investigates neural mechanisms of play behavior in awake-behaving rodents.
Affiliation
Max-Planck-Forschungsstelle für die Wissenschaft der Pathogene (MPUSP)
Research Focus
Unser Labor untersucht Mechanismen der Regulation in Prozessen von Infektion und Immunität mit einem Schwerpunkt auf grampositiven bakteriellen humanpathogenen Erregern. Das Verständnis dieser grundlegenden Mechanismen führt zu neuen Erkenntnissen, die in biotechnologische und biomedizinische Anwendungen übertragen werden können. Ein erfolgreiches Beispiel ist unsere kürzliche Entdeckung eines RNA-gesteuerten DNA-Spaltungsmechanismus, der als RNA-programmierbare Technologie zur Genom-Editierung genutzt wird und aus unserer Analyse des adaptiven Immun-CRISPR-Cas9-Systems in bakteriellen Pathogenen hervorgeht.
Affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
The central nervous system (CNS) depends on the coordinated actions of neurons and glial cells to sustain its remarkable capacity. Our research focuses on how intracellular signalling and cytoskeletal dynamics govern brain homeostasis, synaptic integrity, and resilience during stress or disease. We study these processes at two intimately connected levels: astrocytes and synapses. Astrocytes are essential regulators of neuronal function, maintaining homeostasis, shaping synaptic transmission, and coupling neuronal activity to the vasculature. In response to injury or disease, astrocytes enter a protective state known as reactive astrogliosis, which involves dramatic cytoskeletal and membrane trafficking changes that limit tissue damage and neuroinflammation. We investigate how actin remodeling and intracellular trafficking pathways support astrocyte functions and regulate the blood–brain barrier. In synapses, the actin cytoskeleton also provides structural support, enables receptor trafficking and mediates long-term synaptic changes underlying memory. A current focus is how cytoskeletal regulation is coordinated with stress signaling and autophagy to enhance synaptic resilience. Our work highlights the importance of actin remodeling as a protective mechanism against synapse dysfunction during ageing and in neurodegenerative conditions. By combining live imaging, genetics, CRISPR/Cas9 editing, and molecular analyses, our multidisciplinary program aims to reveal how cytoskeleton-dependent mechanisms in astrocytes and neurons safeguard the CNS. Understanding these protective pathways will not only advance basic neuroscience but also inform therapeutic strategies for brain injury, ageing, and diseases such as Alzheimer’s.
Affiliation
Charité – Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
Klonale Hämatopoese (CH) und Schlaganfall treten beide mit zunehmendem Alter häufiger auf. Aufgrund des Fehlens von Symptomen wird CH häufig nicht diagnostiziert. Wir haben entdeckt, dass CH ein relevanter Risikofaktor für vaskuläre Rezidivereignisse nach einem ersten Schlaganfall ist. Darüber hinaus ist die Art der Mutation, die CH zugrunde liegt, von Bedeutun: insbesondere Mutationen in den Genen für TET2 und PPM1D zeigten hierbei eine starke Korrelation mit wiederkehrenden vaskulären Ereignissen. Die zugrunde liegenden Mechanismen sind jedoch unklar, und ein besseres Verständnis könnte gezielte Behandlungen für ältere Menschen mit CH und Schlaganfall ermöglichen, die gesunde Lebensspanne zu verlängern. Wir werden deshalb ein präklinisches Modell entwickeln, um die Auswirkungen von CH und Tet2- oder PPM1D-mutierten Klonen auf die Physiologie des Wirts zu untersuchen. Dieses Modell wird SCL-Cre-ERT2 und Tamoxifen-Titration verwenden, um physiologische Klone über membrangebundenes Tomato-Protein sichtbar zu machen, während mutierte Klone durch membrangebundenes GFP identifizierbar sind. Unsere zentrale Hypothese ist, dass Mäuse mit großen mutierten Klonen größere Hirnläsionsvolumina entwickeln und eine schlechtere funktionelle Erholung nach einem Schlaganfall zeigen. Wichtig ist, dass wir auch vermuten, dass Tet2- und PPM1D-mutierte Zellen die Blut-Hirn-Schranke (BHS) stärker schädigen und die Endothelinflammation verstärken, was zu einer erhöhten Leukozyteninvasion führt. Weiterhin erwarten wir, dass Tet2- und PPM1D-mutierte Zellen eine höhere sogenannte klonale „Fitness“ aufweisen, stärker proliferieren und höhere Mengen proinflammatorischer Zytokine ausschütten, was zu verstärkter Neuroinflammation nach einem Schlaganfall führt. Dieses proinflammatorische Mikroumfeld könnte sich mit zunehmender Klongröße verschärfen und mit einer schlechteren langfristigen Erholung korrelieren. Vorläufige Daten unterstützen diese Hypothesen, da bei Tet2-mutierten Mäusen eine veränderte BHS festgestellt wurde, die die Leukozyteninvasion begünstigt und zu größeren HIrninfarkten führt. Außerdem gibt es erste Hinweise darauf, dass Herzschäden (das sogenannte „Stroke-Heart-Syndrom“) bei CH+-Mäusen nach Schlaganfall verstärkt auftreten. Wir planen außerdem, die Störung der BHS mittels Tracer-Leakage in Kombination mit Proteomik zu analysieren. Einzelzell-RNA-Seq- und Translatom-Analysen werden zusätzlich klären, wie mutierte Leukozyten die BHS passieren und wie die residenten Gehirnzellen reagieren.
Affiliation
Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP)
Research Focus
Synapsen sind zentral für die Informationsverarbeitung im Gehirn. Fehlfunktionen von Synapsen bilden die Grundlage schwerer neurologischer und psychiatrischer Erkrankungen. Die Entwicklung und Funktion neuronaler Netzwerke hängen wesentlich von der Synthese und Assemblierung präsynaptischer Proteine ab. Diese Prozesse umfassen auch den axonalen Transport von Vesikel- und Active-Zone-Proteinen, die im neuronalen Soma gebildet werden. Wir konnten zeigen, dass ein seltenes spät-endosomales Signallipid den koordinierten axonalen Transport synaptischer Vesikelproteine (SV) und Active-Zone-Proteine in menschlichen Neuronen reguliert. Spannungsgesteuerte Calciumkanäle (VGCCs) sind von diesem Mechanismus hingegen nicht betroffen. Der Transport erfolgt in sogenannten Vorläufervesikeln (PVs). Diese unterscheiden sich klar von klassischen sekretorischen Organellen, Endosomen und lysosomalen Kompartimenten. Vermittelt wird dieser Transport durch einen Proteinkomplex, der die kleine GTPase Arl8A/B sowie das Kinesin KIF1A umfasst und die PVs gezielt zum präsynaptischen Kompartiment leitet. In unveröffentlichten Arbeiten konnten wir zudem zeigen, dass der Verlust von Arl8A/B oder KIF1A (Knockout, KO) in menschlichen Neuronen zu einer reduzierten somatischen Proteinsynthese führt. Parallel dazu ist bekannt, dass viele axonal transportierte Organellen mit mRNAs assoziiert sind, die synaptische oder mitochondriale Proteine kodieren. Auf dieser Grundlage formulieren wir die Hypothese, dass Aufbau, Erhalt und plastische Anpassung von Präsynapsen durch ein koordiniertes Zusammenspiel zweier Prozesse gesteuert werden. Einerseits erfolgt dies über den axonalen Transport somatisch synthetisierter Proteine in PVs sowie in bislang nicht charakterisierten Organellen, etwa im Kontext des VGCC-Transports. Andererseits spielt die lokale Translation der transportierten mRNAs eine zentrale Rolle. Zur Überprüfung dieser Hypothese kombinieren wir mehrere experimentelle Ansätze. Dazu gehören (i) Genom-Editierung in menschlichen Neuronen und Mausmodellen, (ii) quantitative Proteomik mittels pulsed stable isotope labeling by amino acids in cell culture (pSILAC) in Kombination mit Click-Chemie, (iii) Ribosomenprofiling (Ribo-seq) sowie Puromycin-basierte Proximity-Labeling-Methoden, (iv) multimodale Licht- und Elektronenmikroskopie, (v) funktionelle elektrophysiologische Analysen in menschlichen Neuronen sowie (vi) Untersuchungen in Schnittpräparaten genetisch veränderter Mäuse. Wir erwarten, dass diese Studien grundlegende Einblicke in die Rolle des axonalen mRNA-Transports und der lokalen Translation für Biogenese, Stabilität, Plastizität und Funktion von Präsynapsen liefern werden.
Affiliation
Humboldt-Universität zu Berlin (HU)
Research Focus
Während der beiden vorherigen NeuroCure-Förderperioden haben wir Kanalrhodopsine intensiv charakterisiert, entwickelt und modifiziert und K-selektive, Ca-selektive, rotlichtempfindliche sowie dualfunktionale Kanalrhodopsin-Tandems bereitgestellt, die innerhalb von NeuroCure ein breites Anwendungsspektrum finden (AG Jentsch, Larkum, Mikhaylova, Owald, Plested, Schmitz). Dennoch blieben die Einzelkanal-Leitfähigkeit und die Ein- und Ausschaltkinetik der Tore im leitenden Zustand weitgehend unbekannt. Kürzlich konnte in enger Zusammenarbeit mit Klaus Benndorf (Jena) die Einzelkanal-Leitfähigkeit sowie die Ein-/Ausschaltkinetik der K-selektiven Kanalrhodopsine HcKCR und WiChR (links) überwacht und charakterisiert werden. Beide zeigen zwei leitende Hauptzustände mit variablen Zwischenzuständen, deren Ausprägung vom Membranpotenzial abhängt. Im nächsten NeuroCure-Forschungsprogramm werden wir die Leitfähigkeiten, Selektivitäten und Kinetiken verschiedener Kryptophyten-Kanalrhodopsine weiter analysieren, um die grundlegenden Eigenschaften des Schaltverhaltens und der Selektivität zu verstehen. Wir werden versuchen, die Einzelkanalaufzeichnungen von Xenopus-Oozyten auf neuronale ND-Zellen zu übertragen, indem wir das Rauschen systematisch weiter reduzieren. Die Verfeinerung der Einzelkanalaufzeichnung werden wir durch das Testen neuer Screeningstrategien und Materialien angehen und neue Programme zur Datenanalyse entwickeln. Um die Subzustände auf molekularer Ebene zu verstehen, werden wir in Zusammenarbeit mit Han Sun (FMP) die Dynamik des offenen Zustands bei unterschiedlichen Spannungen simulieren und die Kanalrhodopsine entsprechend weiter entwickeln. Die modifizierten Kanalrhodopsine werden funktionell in Neuronen, Drosophila und Fischen getestet, in enger Zusammenarbeit mit den AGs Schmitz, Mikhaylova, Owald und Judkewitz. Das übergeordnete Ziel ist es, die Technologie zu verbessern und bessere Werkzeuge für optogenetische Anwendungen für die Neurowissenschaften bereitzustellen.
Affiliation
Charité – Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
My group plans to extend the current lines of research on the impact of early-life stress (ELS) on brain development, neuroinflammation and neurodegeneration over time. We add a new focus to study model systems of stress exposure using patient-derived induced pluripotent stem cells. Focus 1: We plan to extend our previous studies and further scrutinize the impact of ELS exposure on brain aging, neuroinflammation and neurodegeneration in various cohorts at different age stages and in post mortem brain. We will assess neural and molecular mechanisms of accelerated brain aging and dementia risk and its interaction with glucocorticoid exposure status and inflammation (Collaboration with Matthias Endres and Elisabeth Binder). We will also assess interaction with genomic risk scores and sex as well as effects adversity types and timing. Focus 2: We plan to extend our studies on the impact of sexual abuse and adult sexual activity on somatosensory cortex and genital field thickness (Collaboration with Michael Brecht). This will include 1) longitudinal electronic diary-based studies on current sexual behavior and genital field plasticity, 2) studies using DTI to assess connectivity changes of the genital field after sexual abuse, and 3) studies in children and youth with ascertained reported sexual abuse exposure and genital cortex development through puberty. Focus 3: We will set up a series of studies in cellular model systems to study biological embedding effects of ELS exposure and their reversal. These studies will include neural cell lines from somatic cells obtained from individuals exposed to ELS. These patient-derived cellular model systems will then serve as a preclinical platform to test and guide treatment targets.
Affiliation
Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC)
Research Focus
Unsere Gruppe untersucht, warum psychische Erkrankungen – wie Depressionen, Angststörungen und neuroentwicklungsbedingte Störungen – Menschen so unterschiedlich betreffen. Diese Erkrankungen sind oft stark variabel: Einige Personen erleben nur leichte Beeinträchtigungen, während andere in vielen Bereichen des täglichen Lebens erheblich eingeschränkt sind. Wir erforschen die biologischen Grundlagen dieser Variabilität, mit dem Ziel, Mechanismen aufzudecken, die manche Menschen resilient und andere vulnerabel machen. Dazu nutzen wir Mausmodelle für psychische Störungen und verknüpfen Verhaltensphänotypen mit der molekularen Zusammensetzung von Neuronen und Synapsen. Indem wir Veränderungen auf Proteinebene mit spezifischen Verhaltensmustern in Verbindung bringen, wollen wir die zugrunde liegenden biologischen Signalwege identifizieren, die diese Erkrankungen verursachen und modulieren. Ein besonderer Fokus liegt auf geschlechts- und genderbezogenen Unterschieden. Wir untersuchen, wie biologisches Geschlecht und Hormone Resilienz und Risiko beeinflussen.
Affiliation
Charité – Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
Das Labor untersucht die Pathophysiologie der Kortex-Basalganglien Schleife bei Patienten mit Bewegungsstörungen wie Parkinson, Dystonie und Tremor, sowie deren therapeutische Modulation durch Neuromodulation. Die zentrale Methodik umfasst invasive Aufzeichnungen neuronaler Aktivität aus den Basalganglien beim Menschen. Eine wichtige Erkenntnis der bisherigen Forschung stellt pathologisch erhöhte Synchronisierung im beta-Frequenzbereich der Basalganglien-Kortex-Schleife bei Parkinsonpatienten dar. Dieser Physiomarker korreliert mit der Symptomschwere und wird als Feedback-Signal für die adaptive Stimulation genutzt. Auf der Entwicklung adaptiver Neuromodulation, bei der neuronale Muster als Biomarker dienen, um die Stimulation in einem geschlossenen, bedarfsangepassten und Echtzeit-Loop anzupassen, liegt der aktuelle Forschungsschwerpunkt.
Affiliation
Humboldt-Universität zu Berlin (HU)
Research Focus
Ein kritischer Engpass in den aktuellen Neurowissenschaften ist die lange Verzögerung zwischen viraler Infektion und dem Beginn der Transgenexpression, was Experimente in kurzlebigen Präparaten wie akuten Hirnschnitten oder chirurgisch reseziertem menschlichem Gewebe erheblich einschränkt. Wir schlagen daher vor, einen neuartigen Ansatz auf Basis replikationsdefizienter Semliki-Forest-Virus-(SFV)-Vektoren zu etablieren, die die Expression von Fluorophoren, Calciumindikatoren und Opsinen innerhalb weniger Stunden ermöglichen. Unsere Strategie kombiniert Nagetier- und menschliche Systeme, um die translationale Relevanz zu maximieren. Zunächst optimieren wir das Protokoll in neuronalen Kulturen von Nagetieren sowie in in-vivo-Modellen, wobei wir Expressionskinetik, Zellviabilität und funktionelle Parameter wie Calcium-Imaging und optogenetische Kontrolle quantifizieren. Darauf aufbauend übertragen wir die Methode auf frisch resezierte menschliche kortikale Schnitte aus neurochirurgischen Eingriffen. Dies wird erstmals einen schnellen genetischen Zugang zu menschlichen Neuronen innerhalb ihres begrenzten Viabilitätsfensters ermöglichen. Das Projekt hat eine doppelte Bedeutung für den NeuroCure-Cluster. Auf grundlegender Ebene ermöglicht es eine bislang unerreichte Geschwindigkeit bei der Verknüpfung von Genexpression und neuronaler Physiologie und treibt damit Studien zu synaptischer Integration, dendritischer Verarbeitung und Schaltkreis-Mapping voran. Auf klinischer Ebene könnte die schnelle virale Expression in menschlichem Gewebe eine leistungsfähige Plattform zur Untersuchung krankheitsbedingter Veränderungen der neuronalen Signalübertragung bieten und möglicherweise sogar die Grundlage für zukünftige diagnostische Anwendungen in der neurochirurgischen Praxis schaffen. Durch die Verbindung grundlegender Mechanismen in Nagetieren mit experimentellen Interventionen in menschlichen Neuronen veranschaulicht dieses Projekt die translationalen Ziele von NeuroCure und verspricht einen methodischen Durchbruch mit breitem Anwendungspotenzial.
Affiliation
Leibniz Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP)
Research Focus
Unser Labor untersucht synaptische Übertragung und Plastizität sowie die Frage, wie abnorme Neurotransmission zu Gehirnerkrankungen beiträgt. Da sich Synapsen in ihrer Funktion stark unterscheiden, konzentrieren wir uns darauf, die Mechanismen aufzudecken, die diese funktionelle synaptische Diversität antreiben. Wir entwickeln Methoden, mit denen wir die molekulare Zusammensetzung von Synapsen erfassen können, und kombinieren diese mit Super-Resolution-Mikroskopie und elektrophysiologischen Analysen. Ziel ist es, den funktionellen Zustand einer Synapse mit ihrem molekularen Profil zu verknüpfen. Diese Methoden setzen wir ein, um ein mechanistisches Verständnis der molekularen Veränderungen zu gewinnen, die neuroentwicklungsbedingten und neurodegenerativen Erkrankungen zugrunde liegen – mit besonderem Schwerpunkt auf der amyotrophen Lateralsklerose (ALS).
Affiliation
Humboldt-Universität zu Berlin (HU)
Research Focus
Axontragende Dendriten-(AcD-)Neuronen sind eine besondere Klasse exzitatorischer Neuronen, bei denen das Axon nicht vom Soma, sondern von einem basalen Dendriten ausgeht. In diesen Neuronen können synaptische Eingänge auf den axontragenden Dendriten Aktionspotenziale auslösen, ohne dass eine somatische Depolarisation erforderlich ist. Dadurch wird die perisomatische Hemmung umgangen, ein privilegierter Zugang zum axonalen Output ermöglicht und die Teilnahme an spezifischen Netzwerkoszillationen gefördert, die an der Gedächtniskonsolidierung beteiligt sind. Im Hippocampus kommen pyramidenförmige Neuronen mit AcD-Morphologie vor allem im ventralen Bereich vor, wo sie etwa 50 % der Neuronen ausmachen. Diese Clusterbildung deutet darauf hin, dass der Ursprung des Axons räumlich organisiert ist, um schaltkreisspezifischen Anforderungen gerecht zu werden. Neuere Erkenntnisse legen zudem nahe, dass strukturelle und funktionelle Unterschiede zwischen AcD- und Nicht-AcD-Neuronen – etwa in der AIS-Plastizität – durch neuronale Aktivität moduliert werden können. Dies eröffnet die Möglichkeit, dass sich Anteile von AcD-Neuronen erfahrungsabhängig reorganisieren (Lehmann et al., 2023; Han et al., 2024). Diese Plastizität kann mit zunehmendem Alter abnehmen und ist bei neurodegenerativen Erkrankungen wie Alzheimer (AD) gestört, bei denen sich dendritische Architektur, AIS-Integrität und synaptische Funktion verschlechtern (Criscuolo et al., 2023). Ob und wie diese Veränderungen die Funktion von AcD-Neuronen beeinflussen, ist bislang unklar. Unser Hauptziel ist es, Schlüsselfaktoren zu identifizieren, die die lokale Bildung von AcD-Neuronen im ventralen Hippocampus (vHC) fördern, und die zugrunde liegenden molekularen Mechanismen aufzuklären. Zunächst werden wir untersuchen, ob die Clusterbildung von AcD-Neuronen im vHC mit spezifischen Netzwerkaktivitäten – etwa Sharp-Wave-Ripples – korreliert, da vorläufige Daten darauf hindeuten, dass neuronale Aktivität die Bildung von AcD-Neuronen begünstigt (Lehmann et al., BioRxiv). Darüber hinaus werden wir analysieren, welche zellulären und molekularen Komponenten die Bildung und Umwandlung von AcD-Neuronen im Erwachsenenalter antreiben, mit besonderem Fokus auf der Mikrotubulus-Dynamik und auf MAPs wie Tau und TRIM46, die entscheidend für die Axonbildung und die Entwicklung des AIS sind. Der ventrale Hippocampus ist eng mit dem episodischen Gedächtnis verknüpft. Da dessen Beeinträchtigung ein zentrales Merkmal von Alzheimer ist, werden wir die Populationen von AcD-Neuronen im vHC von AD-Patienten quantifizieren. Diese Ergebnisse sollen klären, ob AcD-Neuronen besonders anfällig für altersbedingten kognitiven Abbau sind.
Affiliation
Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB)
Research Focus
Our main goal is to unravel the diverse mechanisms of mammalian gene regulation and their roles in development and disease. We have developed Genome Architecture Mapping (GAM), an orthogonal 3D genome folding mapping technology which yields fine maps of chromatin contacts from small cell numbers (500-1000), and is uniquely powerful to quantify different metrics of 3D genome structure, such as multiway contacts and chromatin melting. With immuno-GAM, we introduced the selection of cell types from complex tissues to enable the application of GAM in rare cells, such as hippocampal pyramidal glutamatergic neurons. GAM is an inherently suited platform for multimodal molecular phenotyping of biological samples, from genome sequence and 3D structure, to transcript and protein quantification. More specifically, within our cluster we will work on the following topics: 1.Perturbations to Chromatin in developmental disorders (e.g. mutations in HP1γ, ATRX, CTCF, SATB2, Shank3) and the effects of epileptic agents. With the help of transgenic mice, we will analyse changes to epigenomic integrity, gene expression and physiology. In close collaboration with Andrew Newman (Charite), Nathalie Berube (London, Canada), Lucia Peixoto (Washington State University), Angel Barco (Alicante), and Georg Dechant (Innsbruck, Austria). 2. Chromatin in Neurodegeneration. In close collaboration with Susanne Wegmann from the DZNE, we will investigate chromatin architectures preceding and following neurodegeneration, such as under pathogenic Tau.
Affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin, Department of Experimental Neurology; German Center for Neurodegenerative Diseases
Research Focus
The Prüß lab investigates how neuronal autoantibodies shape the onset and progression of neurological and psychiatric disorders, but also aging, bringing together molecular, cellular, and clinical perspectives. By isolating recombinant antibodies directly from patients, we can map epitopes at atomic resolution and examine their functional effects in neuronal cultures, organotypic slices, and animal models, revealing how immune factors disrupt synaptic signaling, behavior, and brain networks. These mechanistic insights provide the foundation for highly targeted therapeutic strategies of antibody-depletion, including selective CAAR-T cells and T cell engagers that selectively eliminate pathogenic B cells. At the same time, we develop diagnostics that accelerate the identification of both known and novel autoantibody targets in patient samples, ensuring that discoveries made at the bench can quickly inform clinical decision-making. The research also extends to maternal–fetal interactions, showing that pathogenic antibodies can cross the placenta and influence brain development, potentially contributing to later psychiatric vulnerability. Taken together, this integrative program demonstrates how basic discovery and translational innovation can be woven into a coherent research strategy. In line with the NeuroCure mission, we harness collective expertise, establish platforms for collaboration, and foster two-way communication between basic and clinical scientists, thus contributing directly to the shared goal of improving outcomes for individuals affected by neurological and psychiatric disorders.
Affiliation
Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB)
Research Focus
How RNA’s are organized to carry out functions in the spatial and temporal organization of polarized cells such as neurons is still a fundamentally unresolved question in Biology, including systems where RNA localization has been linked to disease mechanisms (e. g. Engel et al. 2020, Agrawal and Welshhans 2021). Important questions are how RNA is trafficked into specific compartments, how their function (including translation) is regulated in these compartments, and how the phenotypes are associated with perturbations. We have started a multi-faceted approach to get some new insights into these questions: 1) To systematically quantify the presence of RNA in neuronal compartments at 0.6 micron resolution, and for 100K cells in one experiment, we are adapting our recently published OPEN-ST (spatial transcriptomics in 3D, at subcellular resolution) (Schott et al Cell 2024) including preparing the flow-cell surface with coatings to promote neuronal adhesion and polarity, optimizing conditions for cultured cells to maximize RNA capture efficiency, and applying the established library preparation and analysis stack of Open-ST with computational adjustments for neurite-rich morphologies. With this setup, transcripts can be mapped across subcellular compartments, including soma, proximal and distal dendrites, and axons, using compartment markers registered to the capture array. This design may allow near-organelle quantification of RNAs and, importantly, enables activity-dependent profiling by applying stimuli such as KCl, bicuculline, BDNF, or forskolin directly on the flow-cell. Fixation at defined intervals then captures transcriptional waves, preserving the spatial and temporal context of dynamic RNA regulation. Since thousands of neuronal mRNAs exhibit compartment-specific localization, this approach can directly address key knowledge gaps in how local translation and trafficking logic support synaptic plasticity and neuronal maintenance. 2) In addition to transcript localization, RNA modifications provide another layer of regulation. Marks such as m6A, which modulates RNA stability and translation, and pseudouridine, which strengthens RNA structure, fine-tune neuronal gene expression. To capture these events within our spatial framework, we will implement enzymatic or chemical modifications directly into the Open-ST workflow. This allows modified transcripts to be preserved and later detected in sequencing output, thereby linking subcellular RNA localization with its chemical state. Combining spatial transcriptomics with modification-aware analysis reveals not only where RNAs reside, but also how their chemical regulation supports neuronal plasticity and, when disrupted, contributes to disease. 3) We are developing machine learning methods (GNN’s) and learning on ST data of various formats (incl. MerFish) to learn subcellular localization patterns of RNA molecules to predict RNA localization and derive from these insights into their functions.
Affiliation
Charité – Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
In unserem Labor untersuchen wir die grundlegenden Prinzipien der synaptischen Übertragung, mit einem besonderen Schwerpunkt auf dem Prozess der Neurotransmitterfreisetzung. Die Aufklärung der Mechanismen synaptischer Übertragung und ihrer Regulation ist zentral für das Verständnis von Gehirnfunktion und -dysfunktion. Wir konzentrieren uns insbesondere auf die molekularen Grundlagen dieses Prozesses an zentralen Synapsen und verwenden dabei eine Kombination aus Elektrophysiologie, zellulärem Imaging, Elektronenmikroskopie, Genetik sowie Struktur-Funktions-Ansätzen. Darüber hinaus interessieren uns Moleküle und Mechanismen, die zur Heterogenität der synaptischen Funktion beitragen. In einem separaten Forschungsprogramm übertragen wir unsere Grundlagenansätze auf die menschliche Pathophysiologie. Dazu nutzen wir ein iPSC-abgeleitetes In-vitro-Kultursystem, das alle drei Hauptzelltypen – glutamaterge und GABAerge Neuronen sowie Gliazellen – umfasst. Dies ermöglicht eine tiefgehende Phänotypisierung zellulärer, synaptischer und Netzwerk-Pathophysiologien und stellt eine translationale Pipeline vom Labor zur klinischen Anwendung für neurologische Erkrankungen wie Epilepsie und Autismus-Spektrum-Störungen bereit.
Affiliation
Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC) Berlin
Research Focus
The Sanders Lab studies how somatic mutations arise and shape cell states in health and disease. By developing and applying single-cell and multi-omic methods, our lab investigates genome instability processes and their impact on cellular phenotypes. The goal is to understand how genetic mosaicism emerges, evolves, and contributes to tissue function and disease. Genome instability is a hallmark of aging and a potential driver of neuronal decline. Within NeuroCure, we aim to uncover how both inherited and somatically acquired structural variants contribute to neurodegeneration. By combining Strand-seq, a single-cell DNA sequencing technology that detects sister chromatid exchanges and chromosomal rearrangements in individual cells, with long-read genome assemblies of patient samples, we will capture the full spectrum of chromosomal variation across individuals and cell types. This project will investigate how oxidative stress and DNA repair pathways shape structural mutation patterns and remodel molecular signatures that drive disease.
Affiliation
Freie Universität Berlin
Research Focus
Feeding and metabolism are central to survival and have a profound impact on general health, influencing processes ranging from growth and energy balance to susceptibility to metabolic and psychiatric disorders. Understanding how feeding decisions are regulated at the cellular and circuit level therefore represents a key biological question. In addition, altered metabolic states can compromise cognitive functioning, emphasizing the tight integration of metabolic health with higher-order brain function. The fruit fly Drosophila melanogaster offers an ideal system to uncover fundamental principles, owing to its genetic accessibility, conserved neuromodulatory pathways, and powerful behavioral and physiological assays. Serotonin (5-HT) is a highly conserved regulator of hunger and satiety, yet the cellular and metabolic mechanisms through which it acts remain poorly defined. Emerging evidence suggests that 5-HT influences both mitochondrial function in neurons and metabolic activity in glial cells, processes essential for maintaining excitability and energy balance. Moreover, selective 5-HT reuptake inhibitors (SSRIs) are widely used in psychiatry but their impact on neuronal metabolism and feeding behavior is not well understood. This project aims to dissect how serotonin shapes feeding behavior in Drosophila through three complementary approaches. First, the interaction between 5-HT and co-expressed neuropeptides will be analyzed to clarify how hunger and satiety states are encoded. Second, mitochondrial adaptations in serotonergic neurons under starvation will be investigated to link metabolic plasticity with neurotransmission. Third, 5HT–glia coupling will be studied with a focus on how 5HT and SSRIs influence glial metabolism and feeding behavior. Finally, we will assess how these modulations interact with memory systems to guide cognitive processes, particularly selective memory consolidation. By integrating behavioral assays with advanced biosensors and genetic manipulations, this work will reveal how 5-HT coordinates cellular energy states and circuit dynamics to control feeding and higher cognitive tasks. The findings will not only establish a mechanistic framework for 5HT’s role in nutrient sensing but also provide insight into how pharmacological interventions such as SSRIs alter metabolism and behavior.
Affiliation
Charité – Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
Unser Labor interessiert sich für Synapsen und neuronale Schaltkreise, sowohl in Gesundheit als auch in Krankheit. Um unsere Ziele zu erreichen, nutzen wir einen multidisziplinären Ansatz. Durch die Kombination von Einzelzell- bis Mehrzellaufzeichnungen versuchen wir, die Rolle einzelner Neuronentypen in komplexen Netzwerken zu verstehen. Darüber hinaus verwenden wir Optobiologie – beispielsweise funktionelle Mikroskopie und Optogenetik –, um die Dynamik neuronaler Prozesse zu untersuchen. Konkret werden wir innerhalb unseres Clusters an folgenden Themen arbeiten: 1. Neuronale Schaltkreise. Wir untersuchen, wie neuronale Netzwerke oszillatorische Aktivität erzeugen und wie sich diese Aktivität innerhalb und zwischen verschiedenen Gehirnarealen ausbreitet. Zusätzlich analysieren wir die Konnektivität zwischen verschiedenen Gehirnregionen und die Rolle dieser Interaktionen im Verhalten. Diese Arbeit erfolgt in enger Zusammenarbeit mit Michael Brecht. 2. Pathophysiologie von Entwicklungsstörungen. Dazu zählen Autismus (z. B. Mutationen in SHANK) und Epilepsie (z. B. SYNGAP). Mithilfe transgener Tiermodelle, sowohl Mäuse als auch Ratten, analysieren wir die krankheitsbedingten Veränderungen in neuronalen Netzwerken. In Kooperation mit Markus Schülke von der klinischen Abteilung, Ralf Kühn (MDC) und Sarah Shoichet (Charité) entwickeln wir zudem Proof-of-Principle-Konzepte für Gentherapieansätze. 3. Autoimmunenzephalitis. In enger Zusammenarbeit mit Harald Prüss und Susanne Wegmann von der Klinik für Neurologie und dem DZNE untersuchen wir die Rolle von Antikörpern (z. B. NMDA, LGI-1) bei neurologischen und psychiatrischen Erkrankungen. Aufbauend auf diesen Erkenntnissen entwickeln wir neue therapeutische Interventionen, einschließlich zellbasierter Ansätze wie CAAR-T-Zellen.
Affiliation
Humboldt Universität zu Berlin, Institute for Theoretical Biology
Research Focus
Neuronal networks display a remarkable richness of collective behaviors – from tightly synchronized rhythms to chaotic activity – that are often altered in neurological disease. These states emerge from the interplay between network connectivity and countless cellular mechanisms, yet our mechanistic understanding of which cellular features drive or constrain such dynamics remains incomplete. Our recent studies highlight how the fine-scale dynamics of individual neurons can propagate to the macroscopic level, fostering synchronization, desynchronization, or chaotic transitions. In this project, we aim to unravel the less obvious determinants of such dynamics. Rather than attributing excitability and neural dynamics solely to action-potential generating ion channels, we explore a wider landscape: dendritic and axonal arborization, the activity of ion pumps such as Na⁺/K⁺-ATPase, neuromodulatory and peptidergic influences, dendritic ion channel properties, receptor kinetics, and the energetic status of mitochondria. By focusing on the spatial organization of these parameters across neuronal compartments, we seek to uncover how subtle intrinsic differences reconfigure excitability, producing network-level consequences such as aberrant rhythmicity or depolarization block – phenomena closely linked to disease states. Leveraging advanced mathematical modeling informed by increasingly detailed experimental datasets of high spatial resolution, this project seeks to provide a mechanistic framework connecting single-cell biophysics to pathological network activity, with the long-term goal of identifying novel intervention points in brain disorders.
Affiliation
Charité – Universitätsmedizin Berlin
Research Focus
1. Development of a somatic gene therapy using base editors and virus like particles to treat the SYNGAP1 syndrome. SynGAP syndrome is a severe neurodevelopmental disorder which is associated with severe epilepsy, developmental delay and behavioral abnormalities (autism spectrum disorder). It is caused by dominant de novo mutations in the SYNGAP1 gene, which encodes a Ras GTPase activating protein, which negatively regulates Ras trafficking to the postsynaptic membrane to regulate synaptic plasticity and neuronal homeostasis. The pathophysiology is entirely on the synaptic level and no macroscopic changes can be found on cranial MRI of the patients. In the past funding period (in collaboration with other NC researchers (Sarah Shoichet, Hanna Hörnberg) und colleagues from the MDC (Ralf Kühn, Agnieszka Rybak-Wolff) we have generated the following building blocks toward a therapy (1) a humanized SYNGAP1 mouse with the patient mutation inserted, (2) a base editor that is able to remove the mutation with high efficiency, (3) virus like particle (VLP) for delivery of the base editor, and (4) a disease phenotype in the mice as a read-out for the effect of a somatic gene therapy. Now we want (1) to test various VLPs and base editors in the animal model, especially with regard to the delivery of the base editor to brain neurons, (2) to test the ways of delivery, e.g., systemic versus intrathecally (3) quantify the gene editing of germ cells, and (3) to test the clinical outcome of the treated mice. At the end of this process we want to have all the preclinical data to present to the Paul Ehrlich Institute (PEI) to initiate an individual therapeutic trial in a human patient with a SNYGAP1 mutation. 2. Identification of antibody targets in pediatric neuro-immunological disorders. In the last years we have identified a large number of encephalopathies where the pediatric patients had an inflammatory CSF with increased protein content, presence of lymphoid cells and oligoclonal bands. In many of these patients we found a characteristic staining pattern in the tissue-based assays, without being able to identify the causative antibodies with standard commercial ELISAs or cell-based assays. We are now in a position to identify these antibodies using either (1) a combination of tissue-based assays and mass spectrometry or (2) Phage Immunoprecipitation Sequencing (PhIP-Seq), which is a high-throughput technology to analyze antibody repertoires against a large number of peptides. It makes use of phage-displayed peptide libraries to pull down antibodies from a sample (like CSF), and then using next-generation sequencing to identify which peptides the antibodies bind to.
Affiliation
Freie Universität Berlin (FU)
Research Focus
Our future research will explore how intracellular organelle dynamics and local synaptic mechanisms jointly safeguard brain function during aging. Using Drosophila as a genetically tractable model, we aim to dissect how synaptic resilience is maintained or lost in the face of advancing age, with particular emphasis on presynaptic remodeling, autophagic flux, and mitochondrial function. Building on our prior work on synaptic scaffold dynamics and presynaptic plasticity, we now focus on how aging affects the trafficking and integration of organelles such as endosomes, lysosomes, and mitochondria at synaptic sites. We are particularly interested in identifying conserved molecular modules that mediate the coupling between metabolic state, organelle positioning, and synaptic integrity. Combining high-resolution imaging, functional readouts, and proteomic profiling in aging Drosophila brains, we aim to reveal how age-dependent changes in organelle function contribute to synaptic decline. In parallel, we will develop tools to selectively manipulate these modules in space and time, both to understand their fundamental roles and to test potential interventions. Through comparative studies with mammalian systems, including collaborations within the NeuroCure network, our work aspires to identify shared principles of brain maintenance and resilience. In the long term, we hope to contribute to translational strategies aimed at preserving cognitive function in aging and neurodegenerative disease.
Affiliation
Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE)
Research Focus
Die intraneuronale Akkumulation von phosphoryliertem Tau ist ein pathologisches Kennzeichen in >20 neurologischen Erkrankungen und korreliert mit synapto- und neurotoxischen Effekten in Tau-assoziierten neurodegenerativen Erkrankungen. Dazu gehören die Alzheimer-Krankheit und Subtypen der frontotemporalen Demenz, aber auch Erkrankungen wie Schlaganfall, Epilepsie und Autoimmunerkrankungen. Ein gemeinsames Merkmal dieser Erkrankungen ist eine ausgeprägte Dysregulation der neuronalen Aktivität (akut, langfristig oder wiederkehrende Überanregung). Die Identifikation spezifischer und gemeinsamer Mechanismen, die der pathophysiologischen „Aktivierung“ und Toxizität von Tau in diesem vielfältigen Spektrum an Gehirnerkrankungen zugrunde liegen, wird ein wichtiger Schritt hin zur Entwicklung krankheitsspezifischer und allgemeiner Tau-gerichteter Interventionsstrategien sein. In unserer Forschungsgruppe untersuchen wir verschiedene Aspekte der Tau-Pathobiologie mit dem Ziel, zelluläre und molekulare Mechanismen zu identifizieren, die zur Tau-Aktivierung und Toxizität in der Alzheimer-Krankheit und in Tauopathien beitragen, mit dem Ziel, diese anschließend in neuartige therapeutische Ansätze zu übersetzen. Aktuelle Forschungsthemen behandeln (i) die Hypothese, dass aberrante und übersteigerte neuronale/Netzwerk-Aktivitätsmuster der physiologischen Tau-Aktivierung im Gehirn vorausgehen – als Teil einer Aktivitäts-Stressantwort. (ii) Die bislang wenig erforschte Aktivität von Tau im und am neuronalen Zellkern, einschließlich Protein- und Nukleinsäure-Interaktionen, welche die Genexpressionslandschaft prägen. (iii) Der Unterschied zwischen physiologischen und pathologischen Interaktionen von Tau mit Organellen (Mitochondrien und Lysosomen). Und (iv) die neuronale Funktion und die Treiber der biomolekularen Kondensation von Tau sowie deren Zusammenhang mit Aggregationspathologie; derzeit mit Schwerpunkt auf Studien zur Rolle von Chaperonen und RNA. Zur Beantwortung dieser Fragen verwenden wir ein breites Spektrum an Modellen und Techniken. Dazu gehören biochemische und biophysikalische Analysen, rekombinante Protein-Assays zur Rekonstruktion von Tau-Kondensations- und Aggregationsprozessen, postmortales menschliches Gehirngewebe, Zelllinien und Maus- und menschliche neuronale Kulturen, organotypische und akute Mausgehirnschnitte, innovative virale Vektoransätze, Calcium-Imaging, Mikroskopie und Omics-Ansätze. Die Forschung in unserer Arbeitsgruppe ist hochgradig interdisziplinär und kollaborativ und überbrückt die Bereiche Altern und Erhaltung innerhalb von NeuroCure. Bitte kontaktieren sie uns, wenn Sie Interesse daran haben, Ideen und wissenschaftliche Fragestellungen rund um Tau sowie Mechanismen der Alzheimer-Krankheit und Tauopathien zu diskutieren.